این مؤسسه با داشتن کتابخانه تخصصی، بانک سفال، بخش اسناد، کارگاه مرمت وموزه پژوهش در موارد زیر آماده ارائه توانمندی‌های خود برای رفع نیازهای مراکز اجرایی است.
۱- کاوش و بررسی‌های باستان شناسی در سراسر ایران بصورت مشترک یا مستقل:
بررسی‌های سیستماتیک و علمی
کاوش‌های گسترده، مستمرو هدفمند محوطه‌های باستانی
گمانه زنی و تعیین حریم محوطه‌های باستانی
۲ – مطالعه فضاهای شهری
شهرهای مشهور باستانی ثبت شده در آثار ملی و جهانی همانند سلطانیه
مستند سازی و تعیین اولویت حفاظتی برای بناهای موجود در بافت قدیم شهرهایی مانند تهران، یزد اصفهان، کاشان و ….
۳- مشاوره و مشارکت به منظور ساماندهی، حفاظت و مرمت آثار و اشیای فرهنگی، باستانی موزه‌ها
۴- تدوین راهنما و کاتالوگ علمی برای معرفی و شناساندن بناها و آثار و همچنین اشیای موجود در موزه‌های کشور
۵- برگزاری دوره‌های آموزش پیشرفته برای آشنایی کارشناسان محترم میراث فرهنگی در جهت روزآمد کردن اطلاعات تخصصی با استفاده از امکانات و توانمندی‌های مؤسسه باستان شناسی
۶ – طراحی و ایجاد و راه اندازی بانک‌های اطلاعاتی تخصصی باستان شناسی مانند بانک سفال، بانک اسناد و …..
۷- مطالعه اسناد کتیبه‌ای، مکتوب و نیز آنالیز و شناسایی سکه‌های موجود در مراکز میراث فرهنگی
